Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CALRP27797 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CALRP27797 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALRP27797 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALRP27797 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms