Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNMT1P26358 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DNMT1P26358 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms