Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms