Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS6KB1P23443 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms