Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
S100A1P23297 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
S100A1P23297 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
S100A1P23297 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
S100A1P23297 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
S100A1P23297 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms