Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHA1P21709 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms