Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NF1P21359 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NF1P21359 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NF1P21359 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NF1P21359 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NF1P21359 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms