Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD247P20963 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD247P20963 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CD247P20963 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD247P20963 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD247P20963 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD247P20963 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD247P20963 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD247P20963 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms