Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCNA2P20248 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCNA2P20248 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms