Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC3P19447 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms