Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EGR1P18146 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EGR1P18146 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms