Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms