Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms