Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD8P13378 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms