Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GP1BBP13224 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GP1BBP13224 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms