Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BMP3P12645 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BMP3P12645 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BMP3P12645 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BMP3P12645 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms