Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI3P10071 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI3P10071 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI3P10071 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI3P10071 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI3P10071 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI3P10071 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI3P10071 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms