Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBSLP0DN79 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBSLP0DN79 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBSLP0DN79 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBSLP0DN79 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBSLP0DN79 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBSLP0DN79 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms