Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMIM10L1P0DMW3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms