Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMIGD3P0DMS9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMIGD3P0DMS9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms