Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C8orf88P0DMB2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms