Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPSAP08865 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPSAP08865 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RPSAP08865 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RPSAP08865 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms