Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NGFRP08138 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NGFRP08138 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NGFRP08138 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NGFRP08138 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms