Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPBP07199 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPBP07199 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPBP07199 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms