Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDX58O95786 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDX58O95786 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms