Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POP4O95707 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POP4O95707 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POP4O95707 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POP4O95707 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POP4O95707 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POP4O95707 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POP4O95707 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POP4O95707 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms