Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTDNEP1O95476 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms