Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIX6O95475 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX6O95475 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX6O95475 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX6O95475 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms