Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRAMEF4O60810 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms