Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCL13O43927 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CXCL13O43927 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms