Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYTH3O43739 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYTH3O43739 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms