Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA3O43365 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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