Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DYNC1LI2O43237 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DYNC1LI2O43237 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms