Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIPA1L1O43166 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIPA1L1O43166 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms