Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KDM6AO15550 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM6AO15550 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms