Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
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NPHP1O15259 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPHP1O15259 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPHP1O15259 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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