Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1CO15160 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms