Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SETD1AO15047 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms