Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BHLHE40O14503 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms