Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms