Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
B4E171 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4E171 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
B4E171 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
B4E171 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4E171 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4E171 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms