Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CYSRT1A8MQ03 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms