Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00473A8K010 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00473A8K010 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms