Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
DDB1Q16531 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
DDB1Q16531 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms