Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NKX1-1Q15270 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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