Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AOX1-202ENST00000374700 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RECQL-203ENST00000421138 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 FAM13C-217ENST00000618804 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ATP6V1C1-201ENST00000395862 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SNCA-201ENST00000336904 3041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 EYA1-201ENST00000303824 3930 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 DBIL5P2-201ENST00000443827 253 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD11P31277 A2ML1-205ENST00000539547 3460 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.6 ms