Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZHX3-214ENST00000559234 6296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC129-203ENST00000409210 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIP1-201ENST00000359742 5216 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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