Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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FOXD1Q16676 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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FOXD1Q16676 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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FOXD1Q16676 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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FOXD1Q16676 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
FOXD1Q16676 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
FOXD1Q16676 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
FOXD1Q16676 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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