RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618635.1

5S_rRNA.11-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 84 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.77□□□□□ -0.53
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 FOXD1Q16676 465 aa10.05□□□□□ -0.8
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEDQ86YR6 584 aa9.84□□□□□ -0.83
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 MSH5O43196 834 aa9.59□□□□□ -0.87
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.17□□□□□ -0.94
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.13□□□□□ -0.95
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ADRA2BP18089 450 aa9.09□□□□□ -0.95
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.49□□□□□ -1.05
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.18□□□□□ -1.1
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 RNF39Q9H2S5 420 aa8.12□□□□□ -1.11
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.96□□□□□ -1.14
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.92□□□□□ -1.14
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.88□□□□□ -1.15
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEHQ6S545 545 aa7.67□□□□□ -1.18
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 DSG3P32926 999 aa7.49□□□□□ -1.21
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CAPN15O75808 1086 aa7.48□□□□□ -1.21
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 APLP2Q06481 763 aa7.32□□□□□ -1.24
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ABCB7O75027 752 aa7.24□□□□□ -1.25
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SLC4A2P04920 1241 aa7.16□□□□□ -1.26
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CHRDL2Q6WN34 429 aa7.14□□□□□ -1.27
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POLA2Q14181 598 aa7.01□□□□□ -1.29
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 KCNA4P22459 653 aa6.99□□□□□ -1.29
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 AKT1S1Q96B36 256 aa6.96□□□□□ -1.3
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 HAX1O00165 279 aa6.89□□□□□ -1.31
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.89□□□□□ -1.31
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PITPNM1O00562 1244 aa6.78□□□□□ -1.32
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 OSCARQ8IYS5 282 aa6.77□□□□□ -1.33
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 EVX2Q03828 476 aa6.7□□□□□ -1.34
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.63□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SPDYE6P0CI01 402 aa6.63□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.63□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 LHX8Q68G74 356 aa6.62□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 GABBR2O75899 941 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 FBLN2P98095 1184 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CLCN6P51797 869 aa6.46□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.46□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.46□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PRR29P0C7W0 189 aa6.45□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CHADLQ6NUI6 762 aa6.45□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZBTB22O15209 634 aa6.39□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEIP0CG38 1075 aa6.39□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.26□□□□□ -1.41
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEMA6NI47 508 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 OTUD5Q96G74 571 aa6.24□□□□□ -1.41
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.22□□□□□ -1.41
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEGQ6S5H5 508 aa6.21□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.18□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 POTEB2H3BUK9 544 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 CREBZFQ9NS37 354 aa6.16□□□□□ -1.42
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.13□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PHF12Q96QT6 1004 aa6.11□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 C7P10643 843 aa6.1□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 SLC39A7Q92504 469 aa6.1□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 METRNQ9UJH8 293 aa6.09□□□□□ -1.43
5S_rRNA.11-201ENST00000618635 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.4 ms