Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RN7SKP251-201ENST00000410830 314 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL357127.1-201ENST00000451295 438 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.146-201ENST00000619409 286 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 KIAA0319-206ENST00000616673 5315 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 HRH2-204ENST00000636584 4067 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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HOXD11P31277 AC010332.1-201ENST00000620439 97 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CNDP1-203ENST00000582365 4111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 PALM2-AKAP2-202ENST00000374530 7507 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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